Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7D2

Crbn, Protein cereblon, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrbnQ8C7D2 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrbnQ8C7D2 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrbnQ8C7D2 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CrbnQ8C7D2 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrbnQ8C7D2 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CrbnQ8C7D2 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrbnQ8C7D2 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrbnQ8C7D2 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrbnQ8C7D2 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrbnQ8C7D2 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrbnQ8C7D2 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrbnQ8C7D2 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrbnQ8C7D2 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CrbnQ8C7D2 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrbnQ8C7D2 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrbnQ8C7D2 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrbnQ8C7D2 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrbnQ8C7D2 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrbnQ8C7D2 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrbnQ8C7D2 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrbnQ8C7D2 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrbnQ8C7D2 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CrbnQ8C7D2 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CrbnQ8C7D2 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CrbnQ8C7D2 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CrbnQ8C7D2 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CrbnQ8C7D2 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms