Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Usp20Q8C6M1 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp20Q8C6M1 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms