Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnot2Q8C5L3 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnot2Q8C5L3 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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