Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

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Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ttc21aQ8C0S4 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ttc21aQ8C0S4 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ttc21aQ8C0S4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ttc21aQ8C0S4 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ttc21aQ8C0S4 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ttc21aQ8C0S4 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc21aQ8C0S4 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc21aQ8C0S4 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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