Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Zfp398Q8BV16 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Zfp398Q8BV16 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Zfp398Q8BV16 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Zfp398Q8BV16 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Zfp398Q8BV16 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Zfp398Q8BV16 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Zfp398Q8BV16 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Zfp398Q8BV16 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Zfp398Q8BV16 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zfp398Q8BV16 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Zfp398Q8BV16 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Zfp398Q8BV16 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zfp398Q8BV16 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zfp398Q8BV16 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zfp398Q8BV16 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Zfp398Q8BV16 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Zfp398Q8BV16 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zfp398Q8BV16 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zfp398Q8BV16 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zfp398Q8BV16 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Zfp398Q8BV16 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zfp398Q8BV16 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zfp398Q8BV16 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zfp398Q8BV16 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zfp398Q8BV16 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zfp398Q8BV16 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zfp398Q8BV16 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zfp398Q8BV16 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zfp398Q8BV16 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zfp398Q8BV16 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zfp398Q8BV16 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zfp398Q8BV16 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zfp398Q8BV16 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zfp398Q8BV16 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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