Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ubash3bQ8BGG7 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ubash3bQ8BGG7 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ubash3bQ8BGG7 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubash3bQ8BGG7 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms