Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Atg4bQ8BGE6 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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Atg4bQ8BGE6 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Atg4bQ8BGE6 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Atg4bQ8BGE6 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Atg4bQ8BGE6 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Atg4bQ8BGE6 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Atg4bQ8BGE6 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms