Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NfascQ810U3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms