Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NanogQ80Z64 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms