Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Lrfn4Q80XU8 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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Lrfn4Q80XU8 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Lrfn4Q80XU8 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Lrfn4Q80XU8 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Lrfn4Q80XU8 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Lrfn4Q80XU8 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Lrfn4Q80XU8 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lrfn4Q80XU8 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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