Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NischQ80TM9 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NischQ80TM9 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms