Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccp110Q7TSH4 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccp110Q7TSH4 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccp110Q7TSH4 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccp110Q7TSH4 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccp110Q7TSH4 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccp110Q7TSH4 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccp110Q7TSH4 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccp110Q7TSH4 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccp110Q7TSH4 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccp110Q7TSH4 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccp110Q7TSH4 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccp110Q7TSH4 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccp110Q7TSH4 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccp110Q7TSH4 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccp110Q7TSH4 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccp110Q7TSH4 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccp110Q7TSH4 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccp110Q7TSH4 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccp110Q7TSH4 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccp110Q7TSH4 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccp110Q7TSH4 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccp110Q7TSH4 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccp110Q7TSH4 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccp110Q7TSH4 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccp110Q7TSH4 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccp110Q7TSH4 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccp110Q7TSH4 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccp110Q7TSH4 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccp110Q7TSH4 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccp110Q7TSH4 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccp110Q7TSH4 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccp110Q7TSH4 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccp110Q7TSH4 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccp110Q7TSH4 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccp110Q7TSH4 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccp110Q7TSH4 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccp110Q7TSH4 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccp110Q7TSH4 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms