Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Dsg1cQ7TSF0 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms