Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shq1Q7TMX5 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.7 ms