Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Cnih3Q6ZWS4 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cnih3Q6ZWS4 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms