Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LcorQ6ZPI3 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LcorQ6ZPI3 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LcorQ6ZPI3 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LcorQ6ZPI3 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LcorQ6ZPI3 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LcorQ6ZPI3 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LcorQ6ZPI3 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LcorQ6ZPI3 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LcorQ6ZPI3 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LcorQ6ZPI3 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LcorQ6ZPI3 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LcorQ6ZPI3 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LcorQ6ZPI3 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LcorQ6ZPI3 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LcorQ6ZPI3 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LcorQ6ZPI3 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LcorQ6ZPI3 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LcorQ6ZPI3 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LcorQ6ZPI3 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LcorQ6ZPI3 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LcorQ6ZPI3 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LcorQ6ZPI3 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LcorQ6ZPI3 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LcorQ6ZPI3 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LcorQ6ZPI3 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LcorQ6ZPI3 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LcorQ6ZPI3 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LcorQ6ZPI3 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LcorQ6ZPI3 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LcorQ6ZPI3 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LcorQ6ZPI3 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LcorQ6ZPI3 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LcorQ6ZPI3 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LcorQ6ZPI3 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LcorQ6ZPI3 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LcorQ6ZPI3 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms