Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dtx4Q6PDK8 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Dtx4Q6PDK8 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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