Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ecm29Q6PDI5 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms