Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 1500002F19Rik-203ENSMUST00000211184 375 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm15339-201ENSMUST00000153577 506 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm25735-201ENSMUST00000175164 215 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm14021-201ENSMUST00000117683 961 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm8186-201ENSMUST00000053575 386 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Samd13-201ENSMUST00000124931 905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm23432-201ENSMUST00000157181 131 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm38063-201ENSMUST00000193990 342 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm30052-201ENSMUST00000211951 913 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 CT009550.1-201ENSMUST00000225750 864 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm38246-201ENSMUST00000194318 1511 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
NipblQ6KCD5 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms