Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Krt40Q6IFX3 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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