Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Pdzrn3Q69ZS0 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Pdzrn3Q69ZS0 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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