Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ctnna3Q65CL1 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ctnna3Q65CL1 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ctnna3Q65CL1 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ctnna3Q65CL1 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ctnna3Q65CL1 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ctnna3Q65CL1 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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