Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrn1Q61809 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrn1Q61809 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms