Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Klf3Q60980 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.1 ms