Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Ccdc116-202ENSMUST00000115709 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Fam71bQ5STT6 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms