Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Sap30bpos-201ENSMUST00000132264 2352 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Sft2d1Q5SSN7 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Zfp959-201ENSMUST00000054780 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms