Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TefmQ5SSK3 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms