Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam208bQ5DTT3 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms