Protein–RNA interactions for Protein: Q4FJU9

Tmem40, Transmembrane protein 40, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem40Q4FJU9 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Dnhd1-201ENSMUST00000106776 1146 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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Tmem40Q4FJU9 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Tmem40Q4FJU9 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Tmem40Q4FJU9 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Tmem40Q4FJU9 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Tmem40Q4FJU9 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Tmem40Q4FJU9 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Tmem40Q4FJU9 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Tmem40Q4FJU9 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Tmem40Q4FJU9 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Tmem40Q4FJU9 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Tmem40Q4FJU9 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Tmem40Q4FJU9 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Tmem40Q4FJU9 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Tmem40Q4FJU9 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Med21-201ENSMUST00000032429 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem40Q4FJU9 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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