Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Tecpr2-202ENSMUST00000169597 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Bcl9-207ENSMUST00000166341 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Zfp446-201ENSMUST00000045810 4615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Nbr1-203ENSMUST00000103099 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Arid5b-204ENSMUST00000219238 7581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Gm19656-201ENSMUST00000208543 4610 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Ctnnd1-220ENSMUST00000111694 6362 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Dach2-205ENSMUST00000113382 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Myo6-201ENSMUST00000035889 7871 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Arid1a-201ENSMUST00000008024 6486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Pkd1l2-202ENSMUST00000109093 7389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Pkd1l2-201ENSMUST00000098375 7386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Edil3-201ENSMUST00000043111 5156 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Cdh23-205ENSMUST00000105464 11090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Arhgap21-208ENSMUST00000141298 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Sulf2-202ENSMUST00000109249 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Smim26Q3V460 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.6 ms