Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Nhlrc4Q3UP44 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
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