Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Usp30Q3UN04 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Usp30Q3UN04 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms