Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Parp8Q3UD82 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Parp8Q3UD82 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms