Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Q3U6N9 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Q3U6N9 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Q3U6N9 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Q3U6N9 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Q3U6N9 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U6N9 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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