Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms