Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sec24aQ3U2P1 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms