Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms