Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZI6

Ccnj, Cyclin-J, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnjQ3TZI6 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Gm26574-201ENSMUST00000181876 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CcnjQ3TZI6 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms