Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Eno2-201ENSMUST00000004378 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
InipQ3TXT3 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms