Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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