Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms