Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Ptcd3Q14C51 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Ptcd3Q14C51 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ptcd3Q14C51 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms