Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
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Ttc39dQ0VF76 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc39dQ0VF76 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Ttc39dQ0VF76 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Ttc39dQ0VF76 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Ttc39dQ0VF76 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Ttc39dQ0VF76 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ttc39dQ0VF76 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ttc39dQ0VF76 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ttc39dQ0VF76 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ttc39dQ0VF76 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ttc39dQ0VF76 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ttc39dQ0VF76 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ttc39dQ0VF76 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ttc39dQ0VF76 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ttc39dQ0VF76 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ttc39dQ0VF76 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ttc39dQ0VF76 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ttc39dQ0VF76 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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