Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Itgb8Q0VBD0 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Itgb8Q0VBD0 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Itgb8Q0VBD0 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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