Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Spata18Q0P557 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms