Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Tomm5-203ENSMUST00000107809 738 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm11770-201ENSMUST00000135048 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Scgb3a1-201ENSMUST00000043873 493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Scgb3a1-202ENSMUST00000076006 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gtf2e2-203ENSMUST00000171010 1664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Birc3-202ENSMUST00000115672 2909 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm24066-201ENSMUST00000104515 131 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 1700069L16Rik-201ENSMUST00000047891 537 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Supt4a-201ENSMUST00000093955 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms