Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1r2-ps1-201ENSMUST00000178232 621 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1r2-ps6-201ENSMUST00000179333 621 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm21083-201ENSMUST00000188807 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm31678-201ENSMUST00000198262 454 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ubxn2bQ0KL01 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm14571-201ENSMUST00000118292 570 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm15702-201ENSMUST00000119680 444 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Rpl10-ps6-201ENSMUST00000121321 642 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm12254-201ENSMUST00000134617 471 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm9409-201ENSMUST00000197017 316 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Rpl10-ps5-201ENSMUST00000212707 642 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm3379-201ENSMUST00000222259 642 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm9531-201ENSMUST00000055820 638 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Fdps-201ENSMUST00000081848 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm16013-201ENSMUST00000152249 353 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm16184-201ENSMUST00000162324 573 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Bpifa5-201ENSMUST00000028986 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ubxn2bQ0KL01 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms