Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Klhl7-202ENSMUST00000163409 2857 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gdf3Q07104 Gm28743-201ENSMUST00000189014 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Gm29384-201ENSMUST00000190852 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Gm37538-201ENSMUST00000192417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gdf3Q07104 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gdf3Q07104 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gdf3Q07104 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gdf3Q07104 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gdf3Q07104 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms