Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
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Sh3bp2Q06649 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
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Sh3bp2Q06649 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Sh3bp2Q06649 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Sh3bp2Q06649 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Sh3bp2Q06649 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Sh3bp2Q06649 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Sh3bp2Q06649 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Sh3bp2Q06649 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Sh3bp2Q06649 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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