Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms